Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Tuberkulosis merupakan penyakit yang masih menjadi masalah utama kesehatan bagi masyarakat di Indonesia. Berdasarkan Global TB Report 2021, Asia Tenggara merupakan wilayah dengan beban Tb paling tinggi dan Indonesia menyumbang sekitar 8% dari keseluruhan beban Tb didunia. Namun pasien Tb yang berhasil ditemukan, diobati dan dilaporkan kedalam sistem informasi nasional hanya sekitar 48%. Tb yang resisten terhadap obat terus menjadi ancaman kesehatan manusia. Resistensi terhadap obat anti tuberkulosis bisa terjadi akibat infeksi primer dengan bakteri Tb resisten atau bisa disebabkan oleh pengobatan yang tidak adekuat, sehingga muncul strain yang resisten akibat adanya perubahan atau mutasi pada gen-gen tertentu dalam genom Mycobacterium tuberculosis. Saat ini sudah banyak teknologi dan metode yang digunakan untuk mendeteksi resistensi terhadap obat anti tuberculosis. Salah satunya adalah Next Generation Sequencing. Next Generation Sequencing merupakan teknologi sekuensing akurat, hemat biaya dan throughput tinggi yang memungkinkan penyelidikan genom termasuk Whole Genome Sequencing untuk studi epidemiologi dan untuk mendeteksi penanda resistensi obat dan keragaman strain. Analisis Whole Genome Sequencing dapat digunakan untuk mendeteksi resistensi terhadap obat anti tuberkulosis lini pertama y a n g sangat menjanjikan sebagai pengganti uji kepekaan obat konvensional. Hasil dari analisis Whole Genome Sequencing pada Mycobacterium tuberculosis yang resisten rifampisin menunjukkan adanya mutasi-mutasi yang ada pada wilayah operon Rpo terutama pada gen RpoB dan RpoC. Mutasi yang paling dominan pada gen RpoB adalah perubahan S450L (36,45%) dan pada gen RpoC adalah G594E (30,95%). Dan analisis whole genome sequencing juga menunjukkan adanya mutasi baru yang berbeda dengan mutasi-mutasi yang ada berdasarkan penelitian sebelumnya.

---

Tuberculosis is a disease that is still a major health problem for people in Indonesia. Based on the Global TB Report 2021, Southeast Asia is the region with the highest burden of TB and Indonesia produces around 8% of the total burden of TB in the world. However, only about 48% of TB patients who have been found, treated and reported to the national information system. Drugresistant TB continues to be a threat to human health. Resistance to anti-tuberculosis drugs can occur as a result of primary infection with resistant TB bacteria or can be caused by inadequate treatment, resulting in the emergence of resistant strains due to the presence or mutations in certain genes in the genome of Mycobacterium tuberculosis. Currently there are many technologies and methods used to detect resistance to anti-tuberculosis drugs. One of them is Next Generation Sequencing. Next Generation Sequencing is an accurate, cost-effective and highthroughput sequencing technology that enables genomic investigations including Whole Genome Sequencing to study epidemiology and to detect markers of drug resistance and strain diversity. Whole Genome Sequencing analysis can be used to detect resistance to first-line anti-tuberculosis drugs which are very promising as a substitute for conventional drug sensitivity tests. The results of Whole Genome Sequencing analysis on rifampicin-resistant Mycobacterium tuberculosis showed that there were mutations in the Rpo operon region, especially in the RpoB and RpoC genes. The most dominant mutation in the RpoB gene was the change in S450L (36.45%) and in the RpoC gene was G594E (30.95%)."

"Background: Penyakit Coronavirus (COVID-19) yang disebabkan oleh SARS-COV 2 (Severe Acute Respiratory Syndrome) telah menyebar keseluruh dunia dan menginfeksi lebih dari 180 juta kasus yang dikonfirmasi dan lebih dari 3,9 juta kematian. Manifestasi klinis COVID-19 berkisar dari infeksi tanpa gejala atau infeksi ringan hingga bentuk penyakit parah yang mengancam jiwa. Laporan sebelumnya telah menemukan bahwa obesitas dikaitkan dengan kondisi seseorang yang terinfeksi COVID-19 menjadi parah. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi hubungan obesitas dengan keparahan COVID-19. Metode: Penelitian ini menggunakan desain studi cross sectional pada pasien COVID-19 yang dirawat di Rumah Sakit Universitas Indonesia pada tahun 2020. Data diperoleh dari rekam medis, pengambilan sampel dalam penelitian ini menggunakan total sampling yang memenuhi kriteria inklusi dan ekslusi. Dimana kriteria inklusi adalah pasien dengan informasi lengkap sedangkan untuk kriteria ekslusi adalah pasien yang berusia 18 tahun ke bawah dan hamil. Ada 725 COVID-19 yang disertakan untuk analisis. Kami menggunakan PR yang disesuaikan (dan 95% CI) untuk memperkirakan risiko keparahan COVID-19 yang terkait dengan obesitas. Hasil: Dari 725 pasien COVID-19, 178 mengalami gejala berat. Pasien dengan hipertensi, diabetes, penyakit jantung, dan penyakit ginjal kronis lebih mungkin menderita gejala COVID-19 yang parah. Obesitas dikaitkan dengan keparahan COVID-19 (PR 1,68 dan 95% CI: 1,24-2,26) setelah dikontrol oleh sia, jenis kelamin, diabetes, dan penyakit jantung. Risiko keparahan COVID-19 yang terkait dengan obesitas berbeda berdasarkan jenis kelamin (PR adalah 1,64, 95% CI: 1,14-2,34 pada pria dan 1,69, 95% CI: 0,99-2,88 pada wanita) dan usia (PR adalah 1,77, 95% CI: 1,07-2,29 pada usia yang lebih muda dan 1,48, 95% CI: 1,01-2,17 pada kelompok usia yang lebih tua). Kesimpulan: Obesitas meningkatkan risiko keparahan COVID-19. Menjaga gaya hidup sehat, termasuk olahraga rutin, memilih makanan sehat dan melakukan pemeriksaan kesehatan rutin dapat mengurangi risiko keparahan COVID-19.

---

Background: Coronavirus disease (COVID-19) caused by SARS-CoV 2 (Severe Acute Respiratory Syndrome) has spread worldwide and infected more than 180 million confirmed cases and 3,9 million deaths. The clinical manifestations of COVID-19 range from asymptomatic or mild infection to severe. Previous reports identified that obesity is associated with the condition of a person infected with COVID-19 develop into severe. This study aims at examining the risk of severity COVID-19 associated with obesity.

Methods: A cross sectional study was conducted among COVID-19 patients admitted at the University of Indonesia Hospital in 2020. Patients whose aged 18 or below or pregnant were excluded. Data were obtained from medical records. Cases were selected for the analysis only if the information was completed. There were 725 COVID-19 included for the analysis. We used adjusted PRs (and 95% CI) to estimate the risk of severity of COVID-19 associated with obesity.

Results: Of 725 COVID-19 patients, 178 had severe symptoms. Patients with hypertension, diabetes, heart disease and Chronic Kidney Disease were more likely to suffer severe COVID-19 symptoms. After age, gender, diabetes and heart disease were taken into account, obesity was associated with severity of COVID-19 (PR 1.68 and 95% CI: 1,24-2.26). The severity risks COVID-19 associated with obesity were different based on gender (PRs were 1.64, 95% CI: 1,14-2,34 in men and 1.69, 95% CI: 0.99-2.88 in women) and age (PRs were 1.77, 95% CI: 1.07-2.29 among younger age and 1.48, 95% CI: 1.07-2.29 in older age group).

Conclusion : Obesity increase the risk for severity of COVID-19. Maintain healthy life style, including routine exercise, choice of healthy food and routine medical checkup may reduce the risk of severity of COVID-19."

"Latar Belakang : Kanker paru karsinoma bukan sel kecil (KPKBSK) merupakan jenis kanker paru yang terbanyak. Kesintasan kanker paru terutama ditentukan oleh jenis dan stage kanker. Pada jenis dan stage yang sama masih terdapat perbedaan kesintasan. Inflamasi telah lama diketahui sebagai faktor yang memengaruhi kesintasan pada pasien KPKBSK. Pemeriksaan profil leukosit merupakan pemeriksaan yang murah, cepat dan rutin dikerjakan. Terdapat beberapa penelitian di luar negeri yang meneliti hubungan rasio neutrofil limfosit, rasio trombosit limfosit dan rasio limfosit monosit namun dengan hasil dan titik potong yang beragam. Metode : Penelitian ini menggunakan metode kohort retrospektif pada 148 pasien KPKBSK stage lanjut dengan mutasi epidermal growth factor receptor (EGFR) wild type atau tidak diketahui yang berobat ke RSRRN Persahabatan antara tahun 2018-2019, yang mendapatkan kemoterapi minimal 2 siklus. Dilakukan pencatatan data profil leukosit berupa RNL, RTL dan RLM sebelum menjalani kemoterapi pertama, kemudian diikuti respons klinis berupa kesintasan PFS dan OS. Analisis hubungan antar variabel menggunakan uji korelasi Spearman dan analisis kesintasan menggunakan kurva Kaplan Meier. Hasil : Sampel penelitian 148 pasien KPKBSK stage IIIB-IV dengan proporsi laki-laki 107 orang (72,3%) dan perempuan 41 orang (27,7%). Median usia 57 tahun (16-77 tahun). Didapatkan kanker paru jenis karsinoma sel skuamosa (KSS) sebanyak 83 (56,1%), adenokarsinoma 62 (41,9%) dan adenoskuamosa 3 (2%) dengan performance status (PS) 0-2. Terdapat hubungan yang bermakna antara RNL, RTL dan RLM dengan PFS dan OS. Pasien dengan RNL≥4 memiliki PFS yang lebih rendah (HR=1,689, IK95%:1,189-2,399, p=0,003) dan OS lebih rendah (HR=2,028, IK95%:1,423-2,891, p<0,001). Pasien dengan RTL≥125 memiliki PFS yang lebih rendah (HR=2,229, IK95%:1,226-4,053, p=0,009) dan OS lebih rendah (HR=2,286, IK95%:1,259-4,148, p=0,007). Pasien dengan RLM≥2,5 memiliki PFS yang lebih tinggi (HR=0,464, IK95%:0,316 - 0,682, p<0,001) dan OS lebih tinggi (HR=0,383, IK95%:0,259 - 0,565, p<0,001) Kesimpulan : Nilai RNL, RTL dan RLM memiliki hubungan dengan PFS dan OS pada pasien KPKBSK stage lanjut yang mendapatkan kemoterapi. Baik RNL, RTL maupun RLM dapat digunakan sebagai faktor prognostik pada pasienKPKBSK stage lanjut yang mendapatkan kemoterapi Kata kunci Kemoterapi, KPKBSK, prognosis, rasio neutrofil limfosit (RNL), rasio trombosit limfosit (RTL), rasio limfosit monosit (RLM)

---

Background : Non small cell lung cancer (NSCLC) is the most common type of lung cancer. Lung cancer survival is mainly determined by the type and stage of cancer. At the same type and stage, there are still differences in survival. Inflammation has long been recognized as a factor that affects survival in patients with NSCLC. Examination of the leucocyte profile is an inexpensive, fast and routine examination. There are several studies that examine the relationship between the ratio of neutrophil to lymphocytes (NLR), the ratio of platelets to lymphocytes (PLR) and the ratio lymphocytes to monocyte (LMR) but with varying results and cut points. Methods : This study used a retrospective cohort method on 148 advanced stage NSCLC patients with wild type or unknown mutations of epidermal growth factor receptor (EGFR) who were treated at RSRRN Persahabatan between 2018-2019, who received at least 2 cycles of chemotherapy. Leukocyte profile data were recorded in the form of NRL, PLR and LMR before undergoing the first chemotherapy, followed by clinical responses in the form of PFS and OS survival. Analysis of the relationship between variables using the Spearman correlation test and survival analysis using the Kaplan Meier curve. Results : Total sample was 148 NSCLC patients IIIB-IV with the proportion of 107 men (72,3%) and 41 women (27,7%). The median age was 57 years (16-77 years). There were 83 (56,1%) squamous cell carcinoma (SCC) cases, 62 (41,9%) adenocarcinoma cases and 3 (2%) adenosquamous cases with performance status (PS) of 0-2. There is a significant relationship between NLR, PLR and LMR with PFS and OS. Patients with NLR≥4 had lower PFS (HR=1,689, 95% CI:1,189-2,399, p=0,003) and lower OS (HR=2,028, 95% CI:1,423-2,891, p<0,001). Patients with PLR≥125 had lower PFS (HR=2,229, 95% CI:1,226-4,053, p=0,009) and lower OS (HR=2,286, 95% CI:1,259-4,148, p=0,007). Patients with LMR≥2,5 had higher PFS (HR=0,464, 95% CI: 0,316-0.682, p<0,001) and higher OS (HR=0,383, 95% CI: 0,259-0,565, p<0,001) Conclusion : NLR, PLR and LMR values ​​were associated with PFS and OS in advanced stage NSCLC patients receiving chemotherapy. Both NLR, PLR and LMR could be used as prognostic factors in advanced stage NSCLC patients receiving chemotherapy"

"Latar Belakang: Pneumocystis jirovecii (P. jirovecii) adalah patogen jamur oportunistik yang dapat terdeteksi di saluran napas bawah. Kolonisasi P. jirovecii dapat berkembang menjadi infeksi yang disebut sebagai pneumocystis pneumonia (PCP). Infeksi PCP umumnya terdeteksi di pasien HIV. Pasien tanpa HIV juga dapat mengalami infeksi PCP terutama pada pasien keganasan. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi kolonisasi P. Jirovecii pada sampel bilasan bronkus dengan pemeriksaan polymerase chain reaction (PCR). Metode: Penelitian ini merupakan penelitian potong lintang dengan deskriptif analitik yang pada pasien terduga kanker paru di RSUP Persahabatan. Subjek penelitian adalah pasien terduga kanker paru yang akan menjalani bronkoskopi sesuai kriteria inklusi. Sampel bilasan bronkus dikirim ke Laboratorium Departemen Parasitologi FKUI untuk ekstraksi DNA dan laboratorium BRIN untuk pemeriksaan PCR konvensional. Penelitian ini menggunakan gen MtLSU dan mTSSU. Hasil: Pada penelitian ini terdapat 72 subjek penelitian. Subjek penelitian terdiri atas 51 laki-laki (70,8%). Rerata usia subjek penelitian adalah 56,6 (9,95) tahun. Subjek penelitian sebagian besar memiliki IMT normal (18,5-22,9 kg/m2). Subjek penelitian sebagian besar adalah perokok baik perokok aktif atau bekas perokok yaitu sebanyak 50 orang (69,4%). Sebanyak 23 orang (31,9%) diantaranya memiliki IB berat (IB >600 batang per tahun). Subjek penelitian yang memiliki riwayat pengobatan TB, baik terkonfirmasi bakteriologis maupun diagnosis klinis, sebanyak 23 orang (31,9%). Sebanyak 26 orang (36,1%) memiliki 1 komorbid sedangkan 10 orang (13,9%) memiliki lebih dari 1 komorbid. Berdasarkan pemeriksaan histopatologi atau sitologi bilasan bronkus, dari 72 subjek penelitian terdapat 50 orang (69,4%) terdiagnosis kanker paru, 15 orang (20,9%) bukan kanker paru, dan 7 orang (9,7%) belum diketahui diagnosisnya. Dari 72 sampel yang diperiksa, tidak ada yang menunjukan hasil PCR positif (0%). Kesimpulan: Proporsi P. Jirovecii yang terdeteksi melalui pemeriksaan PCR pada sampel bilasan bronkus pasien terduga kanker paru sebesar 0%. Pemeriksaan PCR untuk mendeteksi P. Jirovecii tidak disarankan untuk pasien kanker yang baru terdiagnosis dan belum dilakukan pengobatan.

---

Background: Pneumocystis jirovecii (P. jirovecii) is an opportunistic fungal pathogen that can be detected in the human lower respiratory tract without signs or symptoms of acute pneumonia or colonization. P. jirovecii colonization can develop into an infection known as pneumocystis pneumonia (PCP). PCP infection is commonly detected in HIV patients. However, patients without HIV can also experience PCP infection, especially in malignant patients. This study aims to detect P. Jirovecii colonization in bronchial lavage samples using polymerase chain reaction (PCR). Methods: This research is a cross-sectional study with descriptive analytics on patients suspected of lung cancer at Persahabatan Hospital. The research subjects were patients with suspected lung cancer who were selected according to the inclusion criteria. Data on clinical, radiological, laboratory and histopathological characteristics were taken from medical records. The patient will have a bronchial lavage sample taken during bronchoscopy for diagnostic purposes. The samples will be examined at the Parasitology Department Laboratory Universitas Indonesia for DNA extraction and the BRIN laboratory for PCR examination. Results: In this study there were 72 research subjects. The research subjects consisted of 51 men (70.8%). The mean age of the research subjects was 56.6 (9.95) years. Most of the research subjects had normal BMI (18.5-22.9 kg/m2). Most of the research subjects were smokers, either active smokers or former smokers, namely 50 people (69.4%). A total of 23 people (31.9%) had severe IB (IB >600 cigarettes per year). There were 23 research subjects who had a history of TB treatment, whether confirmed bacteriologically or clinically diagnosed, as many as 23 people (31.9%). A total of 26 people (36.1%) had 1 comorbid while 10 people (13.9%) had more than 1 comorbid. Based on histopathological or cytological examination of bronchial lavage, of the 72 research subjects, 50 people (69.4%) were diagnosed with lung cancer, 15 people (20.9%) had no lung cancer, and 7 people (9.7%) had no known diagnosis. Of the 72 samples examined, none showed positive PCR results (0%). Conclusion: The proportion of P. Jirovecii detected by conventional PCR examination in bronchial lavage samples from patients suspected of lung cancer was 0%. PCR examination to detect P. Jirovecii is not recommended for cancer patients who have just been diagnosed and have not received treatment."