Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"The study on the community structure of bamboo was done at sub district Srumbung Magelang Central Java Province. This study has been held on October 2010. Fourty plots have been made at sub district Srumbung. The research was done by using purposive sampling technique. From this study, it is shown that were 51 species of bamboo and non bamboo. There are 10 species of bamboo found in these plots. The highest frequency of bamboo Gigantochloa apus (0,5). The highest density is also Gigantochloa apus (2567,5 culm/ha) but Dendrocalamus asper (137,5 clump/ha). The highest density based on clump/ha is Gigantochloa apus (0,320 culm/ha) and Dendrocalamus asper (0,222 clump/ha). When the important value was calculated for clump/ha. The highest dominance is Gigantochloa apus (0,019 culm/ha), and Dendrocalamus asper (0,016 clump/ha). When the dominancy was calculated based on clump/ha. The diversity index showed a low diversity when calculated for culm/ha. The dispersal of bamboo culm and clump is colony and aggregate. The highest culm diameter is Dendrocalamus asper. The highest clump diameter is Gigantochloa atter."

"Biosintesis nanopartikel perak dengan memanfaatkan tumbuhan tropis untuk sintesis nanomaterial yang ramah lingkungan berpotensi untuk dikembangkan. Tumbuhan diketahui memiliki kemampuan untuk mereduksi ion perak menjadi partikel perak berukuran < 100 nm. Nanopartikel perak memiliki potensi untuk diaplikasikan sebagai indikator untuk mendeteksi keberadaan logam berat. Selama ini, deteksi dan pengukuran logam berat yang mencemari lingkungan membutuhkan waktu, serta peralatan dan biaya analisis yang tidak murah. Penelitian ini memanfaatkan 8 jenis tumbuhan, terutama yang terdapat di daerah tropis, sebagai agen biosintesis untuk memperoleh nanopartikel perak. Kedelapan tumbuhan tersebut ialah Azadiracta indica A. Juss (Mimba), Centella asiatica (L.) Urban (pegagan), Cerbera manghas L. (Bintaro), Dillenia indica L. (Dillenia), Diospyros blancoi A. DC. (Bisbul), Murraya paniculata (L.) Jack (Kemuning), Pometia pinnata J. R.Forst & G. Forst (Matoa), dan Phalleria macrocarpa (Scheff.) Boerl. (Mahkota dewa). Dilakukan beberapa variasi proses berupa penggunaan air ebusan dari daun segar dan juga kering, rasio volume air rebusan daun dengan AgNO3. Karakterisasi hasil biosintesis dilakukan dengan spektrofotometer UV-Vis. Pengujian senyawa metabolit sekunder secara kualitatif juga dilakukan untuk mendeteksi keberadaan kelompok senyawa alkaloid, fenol, saponin, terpenoid, dan flavanoid pada tumbuhan yang digunakan. Analisis spektrum UV-Vis dari hasil biosintesis diperoleh 7 jenis tumbuhan menunjukkan diperoleh spektrum UV-Vis dikisaran 400-450 nm yang merupakan spektrum UV-Vis dari nanopartikel perak. Selanjutnya, nanopartikel perak hasil biosintesis menggunakan air rebusan daun Diospyros blancoi (Bisbul) dimodifikasi dengan ligan polivinil alkohol (PVA) dan L-sisteina menjadi larutan indikator. Waktu pencampuran dan konsentrasi ligan dengan nanopartikel perak divariasikan. Larutan indikator tersebut diujikan terhadap larutan ion-ion logam Cu2+, Hg2+, Pb2+, Mn2+, dan Zn2+ pada beberapa konsentrasi. Hasil yang diperoleh menunjukkan pengujian indikator tertentu menghasilkan perubahan warna pada deteksi Cu2+, Zn2+, dan Hg2+ pada kadar 1000 ppm. Hasil yang diperoleh menunjukkan adanya kecenderungan sensitifitas dan selektifitas dari larutan indikator terhadap keberadaan ketiga ion logam tersebut.

---

Tropical plants have high potential for environmentally friendly silver nanoparticle synthesis for many application in nanotechnology. Plants are known to have the ability for silver ion reduction resulting in silver particles sizes < 100 nm. These days, the detection and measurement of heavy metals pollution in an environment requires time, costly equipment, and labored process. This studies tried to obtain silver nanoparticles derived from biological method synthesis using tropical plants and application of the silver nanoparticles as colorimetric indicator. In this study, eight species of plants, mainly located in the tropical region, were used as biosynthetic agents to obtain silver nanoparticles. Theese plants including Azadirachta indica A. Juss (Neem), Centella asiatica (L.) Urban (Pennywort), Cerbera manghas L. (Sea mango), Dillenia indica L. (Elephant apple), Diospyros blancoi A. DC. (Velvet apple), Murraya paniculata (L.) Jack (Orange jasmine), Pometia pinnata J. R. Forst & G. Forst (Matoa), and Phalleria macrocarpa (Scheff.) Boerl. (the God's crown). The biosynthesis process of silver nanoparticles were conducted by boiling the fresh or dried leaves, then reacted with certain volume ratio of AgNO3. Silver nanoparticles were confirmed and characterized from the UV-Vis spectral result. The presence of plant's secondary metabolites gourps such as alkaloids, phenols, saponins, terpenoids, and flavonoids were also tested from the leaves. UV-Vis spectral analysis showed that silver nanoparticles are formed in seven plant species. Further more, silver nanoparticles obtained from biosynthesis using Diospyros blancoi (Velvet apple) leaves broth was modified into indicator solution. The indicator was made by adding ligand polyvinyl alcohol (PVA) and also L-cysteine with silver nanoparticles. The indicator used to detect the presence of Cu2+, Hg2+, Pb2+, Mn2+, dan Zn2+ kations. The testing result of certain modified indicator indicate sensitivity and selectivity to the presence of Cu2 +, Zn2 + and Hg2+ metal ions at 1000 ppm."

"ABSTRAKFicus yang dioecious memiliki dua individu seks yang sangat sulit dibedakanmelalui ciri-ciri eksternal, kecuali saat Ficus berbunga atau berbuah Sebuah studimengenai morfologi bunga Ficus yang dioecious di Universitas Indonesia (UI),Depok telah dilakukan dari bulan Maret 2012 sampai April 2012. Penelitian inibertujuan untuk mengetahui morfologi bunga dari 4 (empat) spesies Ficus yangdioecious di ruang terbuka hijau kampus UI. Penelitian ini juga memeriksahubungan di antara karakter-karakter kuantitatif dari bunga. Sebanyak total 8(delapan) pohon, 8 (delapan) sikonia dan sekitar 750 bunga telah dipilih untukmenjadi sampel. Setiap bunga diukur dengan mikrometer okuler untuk karakterkuantitatif bunga, dan pada saat bersamaan morfologi bunga dari setiap spesiesdibandingkan. Kunci karakter reproduktif dalam mengidentifikasi 4 (empat)spesies Ficus yang dioecious di kampus UI adalah jumlah stamen, bentuk stilusdan stigma, serta bentuk perhiasan bunga (tepal) dari bunga bersari dan bungaberputik. Berdasarkan koefisien korelasi Pearson dan koefisien variasi (KV),hubungan di antara ciri-ciri bunga di keempat spesies menunjukkan bahwapanjang pedisel terlihat merespon terhadap perubahan di dalam semua ciri-ciribunga, terutama pada stilus dan leher sehingga seluruh bunga mencapaiketinggian yang sama. Karakter-karakter yang lain memiliki KV yang rendah,menunjukkan karakter-karakter tersebut tidak bervariasi di dalam sikonium dankurang berkontribusi di dalam pertumbuhan yang seimbang.

---

AbstractIn functionally dioecious fig species, it is quite difficult to distinguish individualsof the two sexes from external characteristics, except when they are in flower orfruit. A study on flower?s morphology of dioecious figs of the UniversitasIndonesia (UI), Depok has been done from March 2012 until April 2012. Theobjective of this study was to know the flower?s morphology of four dioeciousfigs Ficus hispida, F. septica, F. hirta and F. montana available in open area ofUI. This study also examined the relationship among the quantitative of flower?scharacters. A total of eight fig tress, eight figs and about 750 flowers in UI werechosen to be sampled. Each flowers were measured at ocular micrometer for theirquantitative characters and at the same time morphology of fig flowers of all figspecies were compared. The key of reproductive character to identify fourdioecious species of figs available in UI, Depok are number of stamen, style andstigma shape, and perianth (tepal) shape of staminate and pistillate flowers. Basedon correlation coefficients of Pearson and coefficient of variation (CV),relationship among the flower characters show that pedicel length, both in gallfigs and seed figs, appeared to compensate greatly for changes in most of floralfeatures such that all flowers reached a common height. Other characters hadvery low CV?s, suggesting their relative invariance within the syconium andpossibly poor condition to the compensatory growth."

"ABSTRAKIntrusi air laut ke daratan telah menjadi fenomena alam global. Salah satu dampak yang ditimbulkan dari kejadian tersebut adalah perubahan komunitas mikroba. Perubahan komunitas mikroba sangat berpengaruh pada tingkat kesuburan tanah. Pemanfaatan daerah pesisir untuk kegiatan pertanian akan sangat dipengaruhi oleh dampak perubahan tersebut. Pemanfaatan mikroba halotoleran sebagai biofertiliser diharapkan dapat meningkatkan hasil pertanian. Telah dilakukan penelitian mengenai isolasi dan seleksi kapang halotoleran pelarut fosfat dan penghasil IAA serta aplikasinya pada tanaman padi varietas Ciherang untuk mendapatkan isolat kapang halotoleran yang dapat digunakan sebagai agen biofertiliser dalam kondisi lingkungan salin. Diisolasi sebanyak 74 isolat kapang dari lingkungan mangrove Pulau Laki, Kepulauan Seribu dan Suwung, Bali. Tujuh isolat memiliki kemampuan pelarutan Ca-P yang tinggi. Pengujian ketahanan pertumbuhan pada variasi konsentrasi NaCl (0, 2, 5, 10, dan 20%) diperoleh satu isolat, yaitu PBB 3.1 yang mampu tumbuh sampai konsentrasi 20%. Isolat tersebut mampu melarutkan Ca-P sebanyak 68,97 mgL-1 pada konsentrasi 2% NaCl pada inkubasi 72 jam. Produksi IAA tertinggi dicapai pada konsentrasi 0% NaCl, pada inkubasi 48 jam sebesar 0,533 mgL-1. Isolat PBB 3.1 diidentifikasi secara molekular sebagai Aspergillus niger (van Tieghem 1867).Aplikasi inokulan Aspergillus niger PBB 3.1 dilakukan pada skala rumah kaca pada tanaman padi (Oryza sativa L.) varietas Ciherang, dengan variasi konsentrasi salinitas 0; 1,0; 1,5; 2,0 dan 2,5%. Pemberian inokulan Aspergillus niger PBB 3.1 sebanyak 200 g/10 kg pada media tanam berpengaruh terhadap pertumbuhan tanaman padi. Indikasi ini terlihat dari meningkatnya nilai FDA, populasi kapang, tinggi tanaman, jumlah anakan, dan bobot 1000 butir. Pemberian inokulan pada salinitas 0% mampu meningkatkan bobot 1000 butir sebesar 52%. Sedangkan pada salinitas 1,0% terjadi peningkatkan produktivitas sebesar 144%. Mekanisme pengaruh inokulan Aspergillus niger PBB 3.1 masih perlu terus dikaji. Namun, fenomena tersebut membuktikan bahwa isolat Aspergillus niger PBB 3.1 berpotensi untuk dikembangkan sebagai inokulan biofertiliser pada tanaman padi varietas Ciherang yang ditanam dalam kondisi salin sampai 1,0%.;Intrusion of sea water into terrestrial environment is global phenomenon. One of the possible impacts of the sea water intrusion is the soil microbial community structures disturbances. The Change of soil microbial community structure will affect greatly soil fertility, and thus influence utilization of coastal areas for agricultural activities. The use of halotolerant microbes as biofertilizer in coastal areas are expected to increase agricultural yield.

---

This research focused on the isolation and selection of halotolerant fungi and their application for biofertilizer of paddy (Oryza sativa L.) var. Ciherang. The special objective was to obtain halotolerant fungus which is capable of stimulating phosphate solubilization and producing growth hormone (IAA) in saline condition. Seventy four isolates fungi were obtained from mangrove and coastal environment of Laki Island in the Kepulauan Seribu and Suwung, Bali. Seven isolates were having good Ca-P solubilizing capacity. These isolate were further evaluated for their ability to grow under various NaCl concentration 0, 2, 5, 10, and 20%. One isolate Aspergillus (PBB.3.1) was proven to grow at 20% salinity. The strain was able to solubilize Ca-P of 68.97 mgL-1 at salinity 2% after 72 hours, whereas IAA produced maximum 0.533 mgL-1 at 0% salinity after 48 hours. Based on the ITS1 and ITS2 of LSU analyses, this strain was identified as Aspergillus niger (van Tieghem 1867).

Application of Aspergillus niger PBB 3.1 as biofertilizer for paddy (Oryza sativa L.) var. Ciherang was conducted in greenhouse. Five concentration of salinities were evaluated 0; 1.0; 1.5; 2.0 and 2.5%. Using 200 g/10 kg inoculant Aspergillus niger (PBB.3.1) stimulated the growth of paddy as indicated by an increase in FDA, population of fungi, plant height, panicle production and weight of seeds. Using 200 g/10 kg inoculant clearly affected the weight of 1000 grains, which can be seen on the 0% achieved 52% increase, whereas at 10% the weight of 1000 grains was much more stimulated, namely about 144%. The mechanism by which Aspergillus niger PBB 3.1 affect the growth and yield of paddy need further verification.Our experiment clearly noted that Aspergillus niger PBB 3.1 has the potential to be developed as biofertilizer for Oryza sativa L. var. Ciherang grown under saline conditions up to 1.0%.;Intrusion of sea water into terrestrial environment is global phenomenon. One of the possible impacts of the sea water intrusion is the soil microbial community structures disturbances. The Change of soil microbial community structure will affect greatly soil fertility, and thus influence utilization of coastal areas for agricultural activities. The use of halotolerant microbes as biofertilizer in coastal areas are expected to increase agricultural yield."

"ABSTRAKTelah dilakukan penelitian multiplikasi tunas ubi kayu tinggi beta karoten genotipe Ubi Kuning secara kultur in vitro menggunakan dua tipe eksplan, yaitu nodus apikal dan empat nodus aksilar yang ditanam pada medium MS dengan penambahan 0,75 mgl-1 BAP. Penelitian bertujuan untuk mengetahui nodus yang paling responsif terhadap media induksi tunas. Hasil uji Kruskal-Wallis dan analisis variansi (ANOVA) menunjukkan adanya perbedaan nyata (α=0,05) antara perlakuan nodus (Apikal, Aksilar 1, Aksilar 2, Aksilar 3, dan Aksilar 4) dengan rata-rata jumlah tunas, tinggi tunas, jumlah daun, dan panjang daun. Hasil uji lanjut Duncan (α=0,05) menunjukkan adanya perbedaan nyata di antara perlakuan nodus. Respon pertumbuhan yang paling cepat dan seragam terkait tinggi tunas, hari tumbuh tunas, jumlah daun, dan panjang daun ditunjukkan oleh nodus tengah, yaitu nodus aksilar 2 dan 3.

---

ABSTRACTResearch on cassava shoot multiplication of high beta-carotene Ubi Kuning genotype in vitro culture has been done using two different types of explant sources i.e., apical and four axillary buds grow on MS medium containing 0,75 mgl-1 BAP. The study aims to determine the most responsive node for shoot multiplication. The Kruskal-Wallis and ANOVA test showed that various of explants (Apical, Axillary 1, Axillary 2, Axillary 3, and Axillary 4) had significant different (α=0,05) with average value of shoot number, shoot length, leaf number, and leaf length. The Duncan test showed that there was a significant different (α=0,05) between various type of explants. The most rapid growth response that associated with shoot length, leaf number, and leaf length obtained from the 2nd and 3rd axillary buds."

"ABSTRAKKapang rizosfer mempunyai kemampuan menghambatFusarium oxysporum f.sp. lycopersici (Sacc.) W.C. Snyder & H.N. Hans.penyebab penyakit layu pada tanaman tomat (Lycopersicon esculetum Mill.).Kapang rizosfer diisolasi dari daerah perakaran tanaman tomat di lahankonvensional Desa Cikahuripan dan Sukamulya, Sukabumi. Tujuh belas spesiesyang antagonis terhadap F. oxysporum f.sp. lycopersici telah diidentifikasi dari 47isolat yang diisolasi dan 2 isolat koleksi LIPI MC. Mekanisme antagonis untukmengendalikan patogen terlihat beragam dari tiap spesies kapang rizosfer.Kompetisi dengan kapang patogen terlihat pada Trichoderma sp. dan Mucor sp.Semua isolat kapang rizosfer memproduksi agen antifungi volatil bukan HCN dantidak dapat memproduksi enzim kitinase. Kapang rizosfer memproduksi agenantifungi non-volatil iturin yaitu Aspergillus fumigatus Fres., Aspergillus nigerVan Tieghem, dan 2 isolat Aspergillus sp. Enzim protease diproduksi olehA. fumigatus, Aspergillus sp., Fusarium oxysporum Schlecht, danHumicola fuscoatra Traaen. Aspergillus niger dan Penicillium sp., merupakankapang rizosfer yang memproduksi agen antifungi non-volatil dan volatil terhadappatogen. Baik pada suspensi konidia patogen yang disimpan 4° C dan tidakdisimpan dalam lemari pendingin yang diberi agen antifungi non-volatilAspergillus niger (1:1) memperlihatkan persentase hambatan pertumbuhankonidia patogen tertinggi masing-masing 77,97 % dan 76,08 % pada pengamatanjam ke-8. Agen antifungi non-volatil Aspergillus niger pada berbagai konsentrasimeningkatkan perkecambahan tomat masing-masing 4,17 % pada benih tomatyang diberi filtrat atau suspensi konidia patogen yang diinkubasi selama 30 menit.Sedangkan waktu inkubasi 60 menit, agen antifungi non-volatil A. niger padaberbagai konsentrasi meningkatkan perkecambahan tomat 5,25 %?21,04 % padabenih tomat yang diberi suspensi konidia patogen dan menurunkanperkecambahan tomat 6,38 %?13,04 % pada benih tomat yang diberi filtratpatogen. Perpanjangan waktu inkubasi 30 menit menghambat selama 4 harikolonisasi patogen pada tomat yang diberi campuran filtrat atau suspensi konidiapatogen dan agen antifungi non-volatil A. niger pada berbagai konsentrasi. Agenantifungi volatil dari Penicillium sp. dapat menghambat perkecambahan konidiapatogen sebesar 22,07 %.

---

AbstractRhizosphere moulds have activities to reduce the growth of Fusariumoxysporum f.sp. lycopersici (Sacc.) W.C. Snyder & H.N. Hans, the causalpathogen of wilt disease of tomato (Lycopersicon esculentum Mill.) plant.Moulds were isolated from rhizosphere of tomato plants growing in the Villagesof Cikahuripan and Sukamulya, Sukabumi. Seventeen species that haveantagonistic effect to F. oxysporum f.sp. lycopersici were identified from 47isolates isolated from rhizosphere of tomato plant and 2 isolates of LIPI MCcollection. Antagonistic mechanism for control the pathogen seemed differentfrom each species of the rhizosphere moulds. Competition with the pathogen wasproduced by Trichoderma sp. and Mucor sp. All isolates of the rhizospheremoulds produced non-HCN volatile antifungal agent and did not producedchitinase enzyme. Rhizosphere moulds that produced iturin non-volatileantifungal agent were Aspergillus fumigatus Fres., Aspergillus niger VanTieghem, and 2 isolates of Aspergillus sp. Protease enzyme was produced byA. fumigatus, Aspergillus sp., Fusarium oxysporum Schlecht, andHumicola fuscoatra Traaen. Aspergillus niger and Penicillium sp. wererhizophere moulds that produced non-volatile and volatile antifungal agentsrespectively against the pathogen. Both on the suspension of the pathogen conidiastored in 4° C and unstored in refregerator that given non-volatile antifungal agentof A. niger (1 : 1) showed the highest percent inhibition of the pathogen conidiarespectively 77.97 % and 76.08 % in observation to-8 hours. Non-volatileantifungal agent of A. niger at various consentrations increased the germination oftomato respectively at 4.17 % on tomato that given the filtrate or suspension ofconidia of the patogen at 30 minutes incubation. While in the incubation time of60 minutes, non-volatile antifungal agent of A. niger at various concentrationincreased the germination of tomato at 5.25 %─21.04 % on tomato that givensuspension of conidia of the pathogen and decreased the germination of tomato at6.38 %─13.04 % on tomato that given the pathogen filtrate. Extending ofincubation time for 30 minutes 4 days delayed the colonization of the pathogen ontomato that given a mixture of the filtrate or the suspension of the pathogenconidia and non-volatil antifungal agent of A. niger at various concentrations.The volatile antifungal agent of Penicillium sp. decreased the germination ofconidia of the patogen at 22.07 %."

"ABSTRAKPenelitian tentang populasi rotan jernang (Daemonorops draco Willd.) di desaJebak Batanghari, Provinsi Jambi belum pernah dilakukan. Rotan jernangmerupakan tumbuhan penghasil getah jernang yang memiliki banyak manfaat.Pengambilan sampel dalam penelitian ini dilakukan dengan menggunakan metodepurposive random sampling. Data yang diperoleh dianalisis secara deskriptif.Hasil penelitian menunjukan bahwa, populasi rotan jernang hanya 8 rumpun yangterdiri dari 82 individu. Selain rotan jernang juga ditemukan 6 spesies rotan lain.Spesies rotan yang memilik jumlah individu terbesar adalah rotan lilin yaitu 11rumpun yang terdiri dari 197 individu. Rotan jernang merupakan rotan yangmemiliki populasi terkecil dibandingkan populasi rotan jenis lain. Kondisi dilokasi penelitian adalah suhu udara berkisar 20,20C -28,90C; kelembapan udaraberkisar 58%-68%, dan pH berkisar 4,60-4,81. Selain itu, diperoleh 35 spesiestumbuhan yang berfungsi sebagai rambatan rotan jernang sejumlah 73 individu.Jumlah pohon rambatan yang tidak sebanding dengan jumlah Rotan jernangmenyebabkan kematian rotan jernang. Hasil analisis vegetasi diperoleh 51 spesiestumbuhan berdiameter batang > 10 cm terdiri dari 69 individu dengan IndeksNilai Penting (INP) 11 yaitu trembesi, serta 33 spesies tumbuhan berdiameterbatang < 10 cm, yang terdiri dari 60 individu dengan INP tertinggi 20 yaitutrembesi. Hasil wawancara menunjukkan bahwa populasi rotan jernang di desaJebak Batanghari, Provinsi Jambi sudah sulit ditemukan disebabkan pembalakanliar dan perambahan hutan

---

Abstract Research of Rattan Jernang (Daemonorops draco Willd.) population in JebakBatanghari district, Jambi has never done. Daemonorops draco is a plant thatproduces dragon blood. Dragon blood is very useful for Suku Anak Dalam Jambilife. This research uses purposive random sampling method. All of data areanalyzed by description. Based on the research, it shows that exceptDaemonorops draco, there were also found six species of rattan. The populationof Daemonorops draco in Jebak forest was only 8 clamps, consisting of 82individuals. Daemonorops draco had the smallest population among the otherones. The highest population was Calamus javensis, consising of 11 clams 197individuals. The condition of the research location was that the temperature was20.20C -28.90C, the humidity was 58%-68%, and pH was 4.60-4.81. In thislocation, there were also found 35 species of plants (73 individuals) asDaemonorops draco?s vine. The amount of the Daemonorops draco?s vine andDaemonorops draco was not balance, this condition caused the death ofDaemonorops draco in Jebak forest. Based on the vegetation analyze, it wasfound 51 species of plants with diameter > 10 cm consist of 69 individuals thehighest SIV is Pithecolobium saman (11), and 33 species plants with diameter< 10 cm consist of 60 individuals, the highest SIV is Pithecolobium saman (20).Based on the interview, it shows that the population of Daemonorops draco inJebak forest was rare because of illegal logging and forest encroachment"

"Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae atau pneumokokus) dapat menyebabkan Invasive Pneumococcal Disease (IPD), seperti penumonia, meningitis, dan otitis media. Streptococcus pneumoniae memiliki lebih dari 90 serotipe yang berbeda sifat-sifat kepatogenannya. Saat ini, metode molekuler lebih banyak diterapkan dalam penentuan serotipe bakteri tersebut. Penelitian sebelumnya pada anak-anak sehat di Lombok, menemukan bahwa 73 dari 551 isolat merupakan untypeable S. pneumoniae karena tidak dapat ditentukan serotipenya berdasarkan metode PCR multipleks. Pada penelitian ini dilakukan identifikasi lebih mendalam dengan mendeteksi tiga gen yang lestari (conserved genes) pada bakteri S. pneumoniae yaitu, gen psaA, lytA, dan cpsA. Sebanyak 52 isolat (71.2%) terdeteksi dengan PCR mempunyai gen psaA. Sementara itu, gen lytA terdeteksi pada 69 isolat (90.4%) dan gen cpsA terdeteksi pada 37 isolat (50.7%). Berdasarkan hasil deteksi gen psaA, lytA, dan cpsA diperoleh 6 kelompok varian untypeable S. pneumoniae. Analisa sekuens gen recA dengan metode sekuensing, menunjukkan bahwa kelompok varian I (psaA+, lytA+, cpsA+), II (psaA+, lytA+, cpsA–) dan IV (psaA–, lytA+, cpsA+) merupakan bakteri S. pneumoniae. Sementara itu, kelompok varian VI (psaA–, lytA+, cpsA–) merupakan bakteri S. pseudopneumoniae dan kelompok varian VIII (psaA–, lytA–, cpsA–) merupakan bakteri S. infantis. Hasil tersebut mengindikasikan bahwa identifikasi bakteri S. pneumoniae tidak dapat dilakukan hanya dengan satu penanda gen. Hasil penelitian ini penting untuk meningkatkan sensitifitas dari deteksi S. pneumoniae dengan teknik biologi molekuler.

---

Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae or pneumococcus) can cause Invasive Pneumococcal Disease (IPD), such as pneumonia, meningitis, and otitis media. Streptococcus pneumoniae has more than 90 serotypes which differentiated based on the level of pathogenicity. Currently, molecular methods were more widely applied to determine bacterial serotype. Previous studies of healthy children in Lombok, found that 73 of 551 isolates were untypeable S. pneumoniae, because the serotypes can not be determined by multiplex PCR method. This research used a deeper identification by detecting three conserved genes in S. pneumoniae, such as psaA, lytA, and cpsA. A total of 52 isolates (71.2%) were positive for psaA gene by PCR. Meanwhile, lytA gene was detected in 69 isolates (90.4%) and cpsA gene was detected in 37 isolates (50.7%).

Based on the result of psaA, lytA and cpsA gene detection, obtained 6 variants of untypeable S. pneumoniae. recA gene sequence analysis with sequencing method, showed that variant I, II and IV are S. pneumoniae. Meanwhile, variant VI is S. pseudopneumoniae and variant VIII is S. infantis. The results indicated that identification of the bacteria S. pneumoniae can not be done with just one marker gene. The results are important to increase the detection of S. pneumoniae with molecular biology techniques."

"Streptococcus pneumoniaemerupakan bakteri Gram positif yang bersifat patogen pada manusia dan menjadi penyebab Invasive Pneumococcal Diseases (IPD)dengan tingkat kematian yang tinggi. Streptococcus pneumoniae merupakan salah satu flora normal yang terdapat pada saluran pernafasan atas dan nasofaring anak-anak. Kolonisasi merupakan langkah pertama bakteri tersebut melakukan infeksi ke dalam tubuh inang.Kolonisasi lebih dari satu serotipe (multi serotipe/co-colonization) meningkatkan kemungkinan terjadinya infeksi. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan serotipe dan multi kolonisasi bakteri S. pneumoniae dari kultur primer. Sebanyak 150 usapan nasofaring yang diperoleh dari anak-anak diseleksi dengan metode mikrobiologi dan diperoleh sebanyak 67 kultur primer yang diduga mengandung bakteri S. pneumoniae. Sebanyak 67 kultur primer tersebut kemudian diidentifikasi menggunakan pendekatan molekuler, yaitu dengan teknik Polymerase Chain Reaction. Penentuan serotipe dilakukan dengan teknik PCR multipleks. Bakteri S. pneumoniae berhasil diidentifikasi dari 57 kultur primer (38%). Serotipe bakteri S. pneumoniae yang berhasil diidentifikasi pada penelitian ini, yaitu 19F (9), 6A/B (9), 19A (5), 23F (4), 15B/C (3), 7F (3), sg18 (2), 11A (2), 9V (2), 12F (1), 35F (1), 3 (1), 15A (1), 17F (1), 34 (1), 7C (1), dan 11 sampel kultur primer tidak dapat ditentukan serotipenya. Hasil tersebut juga sama dengan serotipe yang dapat ditentukan dari kultur murni. Hanya ditemukan satu dari 67 kultur primer yang mengandung lebih dari satu serotipe bakteri S. pneumoniae. Kesimpulan dari penelitian ini adalah, penentuan serotipe dapat dilakukan langsung dari kultur primer tanpa menggunakan kultur murni dan metode PCR multipleks kurang sensitif dalam mendeteksi serotipe minor.

---

Streptococcus pneumoniae is a Gram-positive bacteria that are pathogenic to humans and cause Invasive Penumococcal Diseases (IPD) with a high mortality rate. Streptococcus pneumoniae is one of the normal flora found on the upper respiratory tract and nasopharynx of children. Bacterial colonization is the first step to carry out infection in the host’s body. Colonization more than one serotype (multi colonization/co-colonization) increases the likelihood of infection. This study aims to determine the serotype and multiple colonization of S. pneumoniae directly from the primary culture. A total of 150 nasopharyngeal swabs were obtained from children and selected by microbiological methods thus obtained 67 suspected primary cultures of S. pneumoniae. Primary cultures from those 67 samples were identified using molecular approaches, namely Polymerase Chain Reaction technique. Serotypes determination was done by using multiplex PCR. Streptococcus pneumoniae were identified from 57 (38%) primary cultures. Serotypes that were identified in this study, namely 19F (9), 6A/B (9), 19A (5), 23F (4), 15B/C (3), 7F (3), sg18 (2), 11A (2), 9V (2), 12F (1), 35F (1), 3 (1), 15A (1), 17F (1), 34 (1), 7C (1), and 11 primary culture samples were non serotypeable. These results are also similar to that were obtained from pure culture, so serotyping with multiplex PCR can be performed directly from primary culture without the use or pure culture. We could only found one of 67 primary cultures that contains more than one serotypes of S. pneumoniae, so we conclude that multiplex PCR method are less sensitive in detecting minor serotypes."

"Telah dilakukan penelitian pengetahuan masyarakat tentang keanekaragaman hayati tanaman berpotensi obat di Desa Wisata Kubu Gadang, Padang Panjang, Sumatera Barat. Tujuan utama penelitian yaitu untuk mengetahui keanekaragaman tanaman obat berdasarkan pengetahuan lokal masyarakat Desa Wisata melalui pendekatan emik dan etik. Metode penelitian dilakukan dengan wawancara dan kuesioner terhadap 80 responden dan 4 orang informan terpilih Pemilihan informan dengan teknik purposive sampling dan snowball. Kuesioner dibagikan kepada 80 orang responden secara acak. Informan terdiri dari Kepala Adat, Ketua RW, Dukun Kampung, dan Tenaga Kesehatan. Pendekatan etik dilakukan dengan menentukan nilai Frekuensi Kutipan Relatif (RFC), Pebble Distribution Method (PDM), dan nilai kepentingan lokal (Local User’s Value Index, LUVI). Berdasarkan hasil perhitungan RFC terdapat sejumlah 42 spesies tanaman yang dikenali dan dimanfaatkan sebagai tanaman obat. sebagai jenis tanaman yang memiliki nilai Frekuensi Kutipan Relatif (RFC) tertinggi adalah simpadeh atau jahe (Zingiber officinale) sebesar 0,95 dan yang terendah tanaman bungo kana sebesar 0,33. Perhitungan PDM dan LUVI menunjukkan bahwa penelitian berhasil mencatat spesies yang memiliki intensitas pemanfaatan dari yang tertinggi ke terendah. Sedangkan perhitungan nilai kepentingan lokal menunjukkan bahwa tanaman jahe merupakan tanaman yang paling dianggap penting dengan nilai PDM 17 dan LUVI 0,84% dan tanaman lado kutu dianggap paling tidak penting dengan nilai PDM 1,25 dan LUVI 0,06%.

---

Research has been carried out on community knowledge about the biodiversity of medicinal plants in Kubu Gadang Tourism Village, Padang Panjang, West Sumatra. The main objective of the study is to determine the diversity of medicinal plants based on local knowledge of the Tourism Village community through an emic and ethical approach. The research method was conducted by interview and questionnaire to 80 respondents and 4 selected informants. Selection of informants using purposive sampling and snowball techniques. Questionnaires were distributed to 80 respondents randomly. The informants consisted of the customary head, the head of the RW, the village shaman, and health workers. The ethical approach is carried out by determining the value of the Relative Quotation Frequency (RFC), Pebble Distribution Method (PDM), and the value of local importance (Local User's Value Index, LUVI). Based on the results of the RFC calculation, there are 42 species of plants that are recognized and used as medicinal plants. as a type of plant that has the highest Relative Quotation Frequency (RFC) value is simpadeh or ginger (Zingiber officinale) of 0.95 and the lowest is Bungo kana plant of 0.33. PDM and LUVI calculations show that the study succeeded in recording species that had the highest utilization intensity to the lowest. While the calculation of the value of local importance shows that ginger is the most important plant with a PDM value of 17 and a LUVI of 0.84% ​​and a lado tick plant is considered the least important with a PDM value of 1.25 and a LUVI of 0.06%."